Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms