Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdk2Q6V4S5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdk2Q6V4S5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms