Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc1Q6TDU8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms