Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms