Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms