Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd1Q6PFY1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd1Q6PFY1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd1Q6PFY1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd1Q6PFY1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fchsd1Q6PFY1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd1Q6PFY1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms