Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms