Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms