Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms