Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gramd2bQ6PEM6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms