Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sarm1Q6PDS3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sarm1Q6PDS3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms