Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms