Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms