Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms