Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slf2Q6P9P0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms