Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrimpolQ6P1E7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms