Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pprc1Q6NZN1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pprc1Q6NZN1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms