Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Soga3Q6NZL0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga3Q6NZL0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms