Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rprd2Q6NXI6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms