Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms