Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms