Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt40Q6IFX3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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