Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf8Q6DID3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms