Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo27Q6DIA9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Fbxo27Q6DIA9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms