Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms