Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cep290Q6A078 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms