Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs2Q66JT5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpgs2Q66JT5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms