Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtprdQ64487 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtprdQ64487 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtprdQ64487 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtprdQ64487 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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