Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PatjQ63ZW7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms