Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms