Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vil1Q62468 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms