Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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