Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20865Q62460 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20865Q62460 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms