Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms