Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp4Q62445 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp4Q62445 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms