Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad2Q62432 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad2Q62432 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad2Q62432 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms