Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha6Q62413 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms