Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms