Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm5dQ62240 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms