Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms