Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms