Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms