Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Npm1Q61937 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Npm1Q61937 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms