Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrc1Q61830 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrc1Q61830 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms