Protein–RNA interactions for Protein: Q61527

Erbb4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb4Q61527 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Erbb4Q61527 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb4Q61527 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms