Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd55bQ61476 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd55bQ61476 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd55bQ61476 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd55bQ61476 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd55bQ61476 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd55bQ61476 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd55bQ61476 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms