Protein–RNA interactions for Protein: Q61382

Traf4, TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4Q61382 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms