Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf1Q61069 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf1Q61069 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf1Q61069 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf1Q61069 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf1Q61069 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf1Q61069 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usf1Q61069 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf1Q61069 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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