Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Neurod1Q60867 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms