Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2cQ60772 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms